随着前申花教练、球员流落到全国各地，在不知不觉中形成了所谓的“申花系”。然而相比之前的实德系、健力宝系所建立的攻守同盟，当下的“申花系”对申花来说却未必是好事，至少对垒申花时，他们或许会拿出吃奶的力量来抗衡申花。
以杭州绿城为例，宋卫平一直梦想着球队能够抗衡申花，因此每次打申花时，他都基本会出现在现场看球，而且还会通过增加奖金等方式刺激球员来拼申花。从过去几个赛季的交锋来说，他的这一招起到了很大的作用，竟然没有在联赛中输给过申花，而且还在主场2比0战胜过申花，2008赛季更是击碎了申花的夺冠梦想。也正因为此，两队的梁子从一开始就结起，而且越结越深。而今随着杜威转会绿城一事闹出的风波，两队的恩怨可谓达到了前所未有的高度。新仇旧恨一起算，势必是今年两队交锋的主旋律。4月10日，申花将在虹口迎战绿城，也是申花新赛季主场首秀，这势必会是一场火星四溅的比赛。当然，以目前绿城队的阵容来看，他们已经不再是前几赛季那支堪堪保级的球队了，中超新的皇马势必会给申花带来不小的麻烦。
除绿城外，将跟申花死磕的应该还有南昌八一队。这支漂泊在外的上海球队，主教练朱炯曾是申花队的助教，在2007赛季朱骏接手申花后，朱炯被新俱乐部抛弃，从而不得不离开上海。对于当下的申花，朱炯应该是憋了一口气。除了教练外，当然包括郑科伟、徐文、杨云等一批被申花抛弃的球员，他们面对老东家势必也会竭尽所能以证明自己。同时，别忘记了，南昌八一队的老板同样来自上海，和申花对阵时，势必会下番功夫来和朱骏比试一番。
除这两支球队外，拥有前申花球员王珂的北京国安，一直以来就是申花的死对头，而河南建业经过这几个赛季的磨砺，已经成为强队，上赛季主场2比0轻松战胜申花就是例子。新赛季，他们依旧是申花的强大对手。
当然，申花在中超里也并非没有好朋友。以深圳为例，去年倾情支援了巴尔克斯、毛剑卿和陈雷三名球员给对手，也在那里赢得了赛季第一场客场胜利。这种友谊在今年得到了延续，赫莱布和扬科继续支援深圳，而申花也从深圳得到了陈永强。除深圳外，跟申花关系保持良好的应该算是长沙金德，这主要是因为陈涛在2009赛季加盟申花的关系。所以，我们看到上赛季的最后一场比赛，申花与金德之战，场上比分的变化几乎可以达到“随心所欲”的境界。
