连续猜中四场比赛，如果以数学方法计算，这种概率大约是1/16，或者6.25%。这已经高得有些不可思议，于是，手握科学知识的人发言了。“科学哥”们除了告诉我们章鱼是一种多么聪明的生物——它有3个心脏，2个记忆系统，大脑中有5亿个神经元——还更多用国旗的颜色来说明问题。
对于这个问题，目前存在着多种版本的说法。其中比较流行的一种说法，认为这其实是德国人提升本国球队士气所玩的一个小把戏。因为章鱼保罗最开始只被用于预测德国队的比赛结果，至于德国国旗上的黑、红、黄三种颜色，恰好与章鱼喜欢使用的虾类颜色非常接近。所以在大多数情况下，章鱼保罗都会主动选择德国国旗，而此举又能在一定程度上鼓舞国家队的士气。
那么在塞尔维亚队与德国队的小组赛中，章鱼保罗为什么选择前者而非后者呢？有人对此的解释，就是塞尔维亚国旗正中的那个标志，在章鱼眼中很像是它们更喜欢食用的蟹，结果就比德国国旗变得更加受欢迎。同样的道理，在预测半决赛结果时，章鱼保罗也选择了中间标志有些象是螃蟹的西班牙国旗。
以上这种“国旗颜色论”，但这种说法立即引发了争议。芝加哥菲尔德自然历史博物馆的Janet Voight博士指出，没有证据显示章鱼具有彩色视觉，因此颜色对保罗的选择偏好影响不大。
中国海洋大学一名海洋生物学博士同样告诉南方周末记者：“章鱼没有识别颜色的能力，他(保罗)肯定是色盲。章鱼属于软体动物门头足纲，如果我没记错，整个头足纲似乎只有萤火鱿是有彩色视觉的。”
这位博士表示，保罗作出预测的事情不要试图用生物学的原因来解释。“不过，无法用生物学知识来解释不代表他没有原因，环境、食物、气味等等都有可能是真正的原因，也许我们需要的是刑侦学的知识。”他说。中国科学院动物研究所张劲硕博士则称章鱼能够分辨颜色，但是否对哪种颜色具有明显偏好并没有科学的研究。他提出了另外一种可能，即随着媒体对保罗预测能力的夸大，对球员们的心理产生影响，而使得比赛结果同样受到影响。
